昆蟲標本制作完成后應存放在昆蟲標本盒里。標本盒要求結構密封、防潮，大小式樣可根據需要和具體情況而定。標本盒盒蓋采用透明玻璃，能集中對標本進行觀察和對比。并采用木頭雙面鑲嵌技術，非一般木頭片做卡口，增加盒子的密封性能及美觀度。標本盒底有一層軟模光板便于插針,存放標本。另外標本存入標本盒前還需要注意這些事項：

　　標本盒消毒存放標本前，標本盒應事先掃干凈，晾干、并用殺蟲劑消毒，通常用或福爾馬林噴殺或熏殺。然后將標本按登記分類順序放入柜里保存。標本入柜后，還必須經常抽查是否有發霉、蟲害、損傷等，如有發現應及時處理。

　　入標本盒前要使標本干透，并在標本盒里放樟腦丸、干燥劑。若標本發霉，可用毛筆輕輕掃去菌絲體，再蘸點石炭酸或福爾馬林涂在標本上，也可用紅外燈烘干，紫外燈消毒。平時取入標本時要隨手關好柜門。

　　此外，在從昆蟲標本盒中取放標本時，因標本之間互相磨擦也會使標本某部份脫落、破碎。這就要求在操作時輕拿輕放，需要取一疊標本中的某一份標本時，必須整疊取出，放在桌上再逐份翻閱，切忌從中硬抽。為減少標本之間的磨損，可用牛皮紙或硬紙將標本逐份或分類夾好。